Подведём итог.
Сотрудник по договору ГПХ - нерезидент.
Место жительства - за пределами России.
Читаем первоисточник:
Цитата: 1. Для целей настоящей главы кдоходам от источников в Российской Федерацииотносятся:...6)вознаграждение завыполнение трудовых или иных обязанностей,выполненную работу, оказанную услугу, совершение действияв Российской Федерации.При этом вознаграждение директоров и иные аналогичные выплаты, получаемые членами органа управления организации (совета директоров или иного подобного органа) - налогового резидента Российской Федерации, местом нахождения (управления) которой является Российская Федерация, рассматриваются как доходы, полученные от источников в Российской Федерации, независимо от места, где фактически исполнялись возложенные на этих лиц управленческие обязанности или откуда производились выплаты указанных вознаграждений;...
Отсюда возникает вопрос - а где оказывает услугу Ваш сотрудник?
Если он организовывает перевозки грузов из России и в Россию, находясь в Армении?
Вот, если бы в перевозках была задействована Армения, то вопрос был бы однозначен - услуги оказываются в Армении.
А здесь во всех перевозках задействована Россия. И в интересах российской организации...
Сам напрашивается вывод - услуга оказана в России. Поскольку в Армении эта услуга Вам не нужна.
К сожалению практика пошла по другому пути. Сейчас много работников уехало за границу и работает там дистанционно. И есть много статей и писем по поводу того, что если у него рабочее место указано за пределами России, то и работа выполняется за пределами России.
Ожидалось, что в 2023 году эту ситуацию подправят, но правка была совершенно не той, что надо и она не прошла.
Поэтому Вам решать, где считать оказанными Вам услуги.
А дальше всё просто.
Если услуги оказаны в России, то это
доход от источника в России и Вы должны исчислить НДФЛ
по ставке для нерезидента и удержать при выплате дохода.
Если Вы придёте к выводу, что услуги оказаны в Армении, то это
доход от источника за пределами России, поэтому исчислять НДФЛ и удерживать его при выплате доходе
не следует. Поскольку он нерезидент.
Видимо, во втором случае он должен будет платить подоходный налог по законодательству Армении или Белоруссии. Но это уже его "головная боль".